2022年3月11日上午9时30分,由永利集团304am登录主办“Accounting for tissue heterogeneity in the analysis of bulk high-throughput omics data”学术报告采用线上腾讯会议的方式成功举办。本次讲座由埃默里大学吴浩教授主讲,学院部分领导、老师及研究生参加了此次讲座。
本次会议的主题为体积大、高通量的生物组学数据分析中的组织异质性。首先,吴教授讲述了单细胞组学数据的科学目标,并指出单细胞实验在大群体水平研究中的应用是困难的,并以奶昔所含的生物细胞进行举例说明。
接下来,吴浩教授介绍了来自异质样本的“批量”高吞吐量数据是来自多个细胞类型信号的加权平均。吴浩教授以老年研究中的EWAS为例,表明了细胞组成随着年龄的变化而变化,这是全血DNA甲基化变化的主要来源。
吴教授借助β值讲解了肿瘤纯度和DNA甲基化,并指出全基因组DNA甲基化呈双峰分布,少数CpG位点具有中等甲基化水平。癌症样本有相当多中间甲基化CpG位点造成的样品混合物。
最后,吴浩教授为大家推荐了分别用于估算肿瘤纯度和分析反褶积和细胞类型特异性分析的实用软件。
讲座内容结束后,吴浩教授就相关内容与广大师生进行了深入的互动交流与探讨,在场的学生认真学习报告精髓,进一步开拓了科研视野。